Thực hiện hiệu quả nhiệm vụ được giao, trọng tâm là công tác kiểm toán, KTNN đã và đang góp phần quan trọng vào công tác phòng, chống tham nhũng (PCTN), từ đó nâng cao vai trò, vị thế của KTNN trong hệ thống các cơ quan nội chính nói riêng, trong hệ thống chính trị nói chung. Tại Hội nghị toàn quốc các cơ quan nội chính triển khai thực hiện Nghị quyết Đại hội lần thứ XIII của Đảng, cùng với các cơ quan trong khối nội chính, KTNN đã được Tổng Bí thư Nguyễn Phú Trọng biểu dương về những thành tích nổi bật trong công tác PCTN.