Những năm qua, kiểm toán quản lý thuế trong cuộc kiểm toán ngân sách địa phương (NSĐP) đã đạt được kết quả tích cực. Số kiến nghị truy thu nộp ngân sách khá lớn, chiếm tỷ trọng cao trong tổng số kiến nghị xử lý tài chính của đơn vị. Đồng thời, nhiều kiến nghị giúp địa phương khắc phục hạn chế trong công tác chỉ đạo, điều hành quản lý thuế. Để có được kết quả này, KTNN luôn chú trọng khâu tổ chức thực hiện kiểm toán.